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咸宁学院基础医学院前身为创建于1965年11月的咸宁医学院基础学部，2008年7月单独建制。
经过四十余年的建设，基础医学院已成为全校基础医学的教学、科研和社会服务基地。
基础医学院现有5个系，13个教研室，1个省级基础医学实验教学示范中心， 1个生命科学标本陈列馆。
共开设公共卫生管理学和预防医学2个本科专业。
有病理学1门省级精品课程，人体解剖学与组织胚胎学、生物化学、生理学等3门校级精品课程，有人体解剖学与组织胚胎学、病理学2个校级重点建设学科，人体解剖学与组织胚胎学为硕士研究生联合培养点。
承担了临床医学、眼耳鼻喉科学、医学影像学、口腔医学、护理学、公共事业管理、预防医学、药学、生物医学工程等各专业、各层次的基础医学课程的教学工作。
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